توفر بورصة البحرين خدمات التسوية و الإيداع المركزي و خدمات ما بعد التداول لجميع الأوراق المالية و الأصول المتوفرة على منصة البورصة. و تهدف خدمات التسوية و الإيداع المركزي إلى تقديم بنية تحتية مالية لتسويات ما بعد التداول بشكل فعال مما يمكن من حفظ الأوراق المالية في بيئة آمنة ومضمونة. تحفظ بورصة البحرين تحت عهدتها 21 مليار دولار أمريكي كقيمة الأوراق المالية و التي تمثل 33 مليار من الأوراق المالية من 100 جنسية مختلفة. بعض الخدمات التي توفرها خدمات التسوية و الإيداع المركزي تشمل:
- خدمات التسوية
- خدمات التسجيل المركزي
- خدمات الإيداع المركزي
- إجراءات إعلانات الشركات
- إدارة إجتماعات الجمعية العمومية
- خدمات الحافظ الأمين
- إجراء عمليات الرهن
- عمليات التحويل المستثناة
- خدمات الإكتتاب
- خدمات الحساب الإلكتروني